Du Séquençage d’AnaplasMa PhagocytophiLum à l’Elucidation de sa taxonomie et de sa biologie (SAMPLE)
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Doctorat
Anaplasma phagocytophilum (Aph) est une bactérie pathogène pour les animaux et les humains, dont l’importance ne cesse de croître. On ignore presque tout, particulièrement en Europe, de cette bactérie très diversifiée : quels sont les liens entre les souches infectant les animaux domestiques et l’Homme, quelles espèces sauvages sont source de leur infection. Ces lacunes sont des obstacles majeurs au diagnostic, au dépistage et à la lutte. Aph étant très difficile à étudier (elle est intracellulaire stricte et pousse dans très peu de cellules), le recours à de nouveaux outils de séquençage rend désormais possible l’exploration de la diversité et la comparaison des souches. Savoir si les différentes souches font partie ou pas de la même espèce génomique, établir les cycles et définir des marqueurs de souches (zoonotiques, abortives…) permettra d’améliorer le diagnostic et de cibler la lutte contre cette zoonose émergente.