Caractérisation du MICROenvironnement INFectieux par immunofluorescence hyper-plex pour l’étude physiopathologique des infections
Responsabilité scientifique :
BOURDOULOUS Sandrine
Axes de recherche :
Les maladies infectieuses ont pour origine un ou plusieurs agents infectieux. Cependant, leur expression est fonction du pouvoir pathogène de ces agents, modulé par un ensemble de facteurs variables : susceptibilité de l’hôte, facteurs génétiques, environnementaux, immunitaires, interaction avec d’autres pathogènes etc. L’étude de l’interaction de ces pathogènes avec leur hôte et en particulier du « microenvironnement infectieux » (i.e. l’environnement qui favorise la colonisation par des agents pathogènes, et qui, une fois colonisé, assure une protection contre les antibiotiques / traitements et la fonction immunitaire) est fondamentale à notre compréhension de ces maladies et pour l’évaluation du risque infectieux.A l’Institut Cochin, seize équipes regroupées au sein de l’Axe Microbiologie étudient des pathogènes, bactériens viraux ou parasitaires responsables de maladies infectieuses chroniques, récurrentes ou récidivantes d’une relevance épidémiologique importante et qui constituent un défi de santé publique. Plusieurs équipes étudient également le rôle des systèmes immunitaires inné et adaptatif dans les maladies inflammatoires et infectieuses.Le projet MICROINF, porté par Sandrine Bourdoulous (responsable de l’Axe Microbiologie) vise à comprendre pourquoi les infections causées par ces bactéries, virus ou parasites ne peuvent être combattues avec succès par le système immunitaire et/ou résistent aux traitements. L’objectif est d’entreprendre une analyse détaillée des microenvironnements infectieux, d’en analyser l’impact sur la physiopathologie de ces diverses infections, dans le but de développer de nouveaux outils ou stratégies thérapeutiques.Les progrès récents en matière de séquençage de l’ARN, de métabolomique et de microscopie permettent à présent de caractériser le microenvironnement des infections et de valider la pertinence clinique des conditions in vitro/ ex-vivo par rapport aux infections réelles. L’Institut Cochin est équipé en matière de séquençage haut débit, analyses métaboliques, mais manque d’un système d’imagerie performant permettant d’analyser la complexité des tissus et d’étudier directement in situ les interactions entre les nombreuses populations cellulaires qui le composent. L’acquisition par la plateforme d’Histologie, Immunomarquage et Microdissection laser de l’Institut Cochin (HistIM), d’un appareil d’imagerie couplant marquages hyper-plex et un système d’acquisition et d’analyse d’images automatisées, tel que proposé par la société Miltenyi avec son système d’imagerie Multiplexing MACSima, permettrait de répondre à un besoin croissant des équipes de l’Axe Microbiologie pour l’analyse du microenvironnement infectieux.
chroniques, récurrentes ou récidivantes