Préparation et Contrôle Qualité des librairies NGS pour l’étude des interactions microorganismes-environnement
Coordinator :
Linda DUVAL
Partners :
UMR 7245 (Molécules de Communication et Adaptation des Microorganismes); Service de Systématique Moléculaire (SSM), CNRS
Financement :
-1 Système automatisé d’électrophorèse pour la sélection de taille de l’ADN en NGS (Blue Pippin, Ozyme)
-1 Fragment Analyzer™Automated CE System – 12 capillaires
-1 QX200™ Droplet Digital™ PCR System & EvaGreen® ddPCR
-1 Thermocycleur BioMetra Trio
-1 Congélateur -80°C
Le MNHN prévoit de mettre à niveau son service de biologie moléculaire SSM avec l’installation de différents équipements de dernière génération pour permettre la construction de données de références pour des génomes méconnus, de développer les approches métagénomiques pour l’étude de la diversité dans des échantillons complexes (ex. holobionte, ADN/ARN environnemental, etc.), d’associer des données de diversité génétique (ADN) et de diversité fonctionnelle (ARN), ou encore de mettre en oeuvre des protocoles de séquençage haut-débit dans le cadre de programmes en cours d’interface Biodiversité-Santé.